$1.000 genom på to timer i 2012, siger administrerende direktør for Ion Torrent

Det mytiske $1.000-genom er næsten over os, sagde Jonathan Rothberg, administrerende direktør for sekventeringsteknologivirksomheden Ion Torrent, på MITs Emerging Technology-konference. Hvis hans forudsigelse går i opfyldelse, vil det repræsentere en forbløffende triumf i den hurtige teknologiske udvikling. Den hastighed, hvormed genomsekventering er blevet mere overkommelig, er hurtigere end Moores lov . (Du kan læse en Q&A BØRN gjorde med Rothberg tidligere på året her , og en profil af hans virksomhed her ).

Jonathan Rothberg, leder af Ion Torrent, taler ved EmTech 2011

På dette tidspunkt næste år sekventere menneskelige genomer så hurtigt og billigt som bakteriel genom, sagde Rothberg. (Tidligere havde han kommenteret, at hans virksomhed nu kan lave et helt bakteriegenom på omkring to timer.)

Jeg var i rummet den 19. oktober, da han sagde det, og jeg ville have troet, at det var ren hybris, hvis det ikke var for Rothbergs utrolige track record på dette område, fra grundlæggelsen af ​​den succesfulde tidligere generations sekvenseringsvirksomhed 454 Life Sciences til de seneste gennembrud med Den samme teknologi, som han foreslår, vil få os til $1.000-genomet.

Denne teknologi, kaldet, kaldet Personlig genommaskine , bliver allerede brugt til at bestemme hvilke mutationer der er til stede i genomet af patienters kræftsygdomme .

The Personal Genome Maker dukker allerede op i kliniske laboratorier, selv lægekontorer

Nøglen til dette gennembrud, siger Rothberg, er, at PGM ikke er afhængig af konventionel våd kemi til at sekventere DNA. I stedet virker det næsten helt igennem konventionel mikrochipteknologi , hvilket betyder, at Ion Torrent udnytter årtiers investeringer i konventionelle transistorer og chips.

Så hvordan ser alderen på $1.000-genomet ud? Indtil vi ved, hvad flere af disse gener faktisk korrelerer med, vil det for de fleste af os ikke være så forskelligt fra nutiden.

Lige nu har der ikke ret mange sammenhænge mellem de 3 milliarder basepar [af det menneskelige genom] og resultater eller medicin, siger Rothberg. Han forudser, at det vil tage mindst 10 år med kliniske eksperimenter med fuld genomsekventering at få os til det punkt, hvor vi kan begynde at låse op for dets værdi.

Og der vil gå 20 år, før vi forstår kræft på samme niveau som hiv og kan finde på kombinationer af medicin [skræddersyet] til hver enkelt, siger Rothberg.

Du kan se en fuld video af hans foredrag på Tech Review's EmTech-side.

skjule