AI kan advare forskere, hvor CRISPR kan begå en fejl

Kategori: Bioteknologi Udsendt 10 jan

Microsoft har bygget et kunstig intelligensværktøj der forudsiger nøjagtigheden af ​​CRISPR, så forskere kan undgå at lave forkerte redigeringer i DNA.

Mangler målet: CRISPR bruger to komponenter: et skærende protein og et guide-RNA, der leder det til den del af et genom, du vil skære. Guide-RNA'et er omkring 20 bogstaver langt. Problemet er, at flere steder i et genom kan have den samme serie af bogstaver, så CRISPR kunne klippe den forkerte sektion - kendt som en off-mål-effekt.

Hvorfor det betyder noget: Effekter uden for målet er en af ​​de største sikkerhedsproblemer med CRISPR. At lave forkerte snit i et genom kan f.eks. tænde for et kræftfremkaldende gen.

Sådan hjælper AI: Microsofts værktøj lader forskere tilslutte et gen, de ønsker at ændre, og få et skøn over, hvor dårlige potentielle effekter uden for målet kan være. Ved at bruge værktøjet kunne forskerne finde ud af, hvilke gener der er sværest at redigere sikkert, og undgå at justere dem, siger Nicolo Fusi fra Microsoft Research.