Baser til bytes

Omkostningerne ved at sekventere menneskelige genomer er faldende - i de mest avancerede genomiske centre falder de fem gange hurtigere end omkostningerne ved computing. I stigende grad får folk deres DNA sekventeret af virksomheder og forskningslaboratorier i en søgen efter spor om genetisk variation og sygdom.

Men industrien skal finde ud af, hvordan man billigt opbevarer alle de resulterende data. Hvert af de 3,2 milliarder DNA-basepar i et menneskeligt genom kan kodes af to bits - 800 megabyte for hele genomet. Men betydelige data om hver base er normalt indsamlet, og gener er ofte sekventeret mange gange for at sikre nøjagtighed, så det er almindeligt at spare omkring 100 gigabyte, når man sekventerer et menneskeligt genom med en maskine lavet af industrileder Illumina. At opbevare så mange data om hver person på planeten ville kræve omtrent lige så meget digital lagring, som var tilgængelig i hele verden i 2010.

Denne historie var en del af vores maj 2012-udgave

• Se resten af ​​problemet
• Abonner

Tricket bliver så at spare mindre. Harvard-genetikeren George Church siger, at det i sidste ende kun er forskellene mellem et nyligt sekventeret genom og et referencegenom, der skal lagres. Den information kunne kodes i så lidt som fire megabyte. Så er dit genom måske bare endnu en vedhæftet fil i en e-mail.

Informationsgrafik af Infographics.com

skjule