Forudsiger dit genom dit ansigt? Ikke helt endnu

Proceedings of the National Academy of Sciences, MIT Technology Review

Mandag, det californiske genjagtfirma Human Longevity udgivet et papir med den dristige påstand, at den kan identificere individer, der bruger deres genomer til at forudsige, hvordan deres ansigter ser ud.

Påstanden - at dit DNA kan bruges til at skabe en fotolignende rekonstruktion af dig - har potentielt store implikationer. Det ville give politiet mulighed for at vælge mistænkte ud af en lineup ved hjælp af en blodplet, og det ville betyde, at intet genom indsamlet til forskning er virkelig privat.

Men en visnende reaktion på ansigtsforudsigelsespapiret fra videnskabsmænd på sociale medier er sandsynligvis ikke, hvad Human Longevitys grundlægger, den berømte genomikekspert J. Craig Venter, havde i tankerne.

Ifølge to eksperter, der har gennemgået avisen - og en tidligere ansat - kan Venter faktisk ikke vælge en person ud af en mængde ved hjælp af et genom, og hans rapport havde svært ved at finde en udgiver.

Craig Venter kan ikke forudsige ansigter, sagde Yaniv Erlich, den videnskabelige chef for MyHeritage.com, en slægtsforskningshjemmeside, ligeud på Twitter. For at gøre pointen, Erlich indsendt Venters forudsigelse af sit eget ansigt og bemærkede, at det mere lignede skuespilleren Bradley Cooper end biologen, der blev entreprenør.

Venters team brugte genomdata til at forudsige ansigtsform, øjen- og hårfarve, og endda hvordan din stemme lyder og smeltede dem sammen til billeder, som de sagde var nøjagtige nok til at genidentificere, hvis genom det var.

Men skeptikere siger, at Human Longevity faktisk bruger en persons race og køn - let målt ud fra enklere DNA-tests og ikke en ny idé - til at skabe billeder, der portrætterer gennemsnitlige ansigter, ikke specifikke, som firmaet sagde.

Relateret historie

Relateret historie Genforskning og databehandling i Silicon Valley-stil begynder at smelte sammen.

Ved at bruge sin metode rapporterede virksomheden, at det kunne vælge den rigtige person fra en række af 20 fotografier omkring 70 procent af tiden. Men efter at have kasseret folk af et andet køn og race end emnet, faldt nøjagtigheden drastisk. Brugt til at vælge en specifik europæisk mand ud af en række af 20 andre europæiske mænd, var det rigtigt 11 procent af tiden.

Ansigtsforudsigelsen er blot at forudsige det gennemsnitlige ansigt for dit løb. Du vil altid sige, 'Wow, den slags ligner mig', siger Jason Piper, en genetikekspert, der arbejdede hos Human Longevity. Piper, der er opført som forfatter til avisen, men nu er ansat hos Apple, tog også til Twitter for at kritisere dets konklusioner som uberettigede.

Stor risiko

Ansigtsundersøgelsen var beregnet til at vise mulighederne i Human Longevity, som har rejst omkring 300 millioner dollars til at sekventere en million menneskelige genomer. Forretningsplanen: Opret den største DNA-database på planeten og frigør genomets kraft til at lave sundhedsforudsigelser.

Bestræbelsen på privat at samle geninformation gentog Venters kontroversielle rolle i det oprindelige Human Genome Project, da han løb videnskabsmænd fra den offentlige sektor for at færdiggøre et første udkast. Hans indsats på det tidspunkt for at skabe et Bloomberg af DNA-data gennem hans tidligere firma Celera, lykkedes ikke.

Med sit nye forehavende hjalp Venters store navn og ambition ham igen med at tiltrække stjerner, såsom maskinlæringsspecialist Franz Och, der kom med fra Google for at knuse data. Hos en Health Nucleus i San Diego begyndte Venter at tilbyde ultra-detaljerede medicinske undersøgelser, der kostede så meget som $25.000. Inkluderet er en genomaflæsning og en personlig videnskabelig plakat, der viser en kundes gener.

Ansigtsforudsigelsesprojektet blev iværksat for at demonstrere værdien af ​​disse tilbud. Når alt kommer til alt, hvis Venter kan printe dit ansigt fra dit DNA, så må Human Longevitys medicinske undersøgelser være det værd. Hvis jeg fortæller dig, at du er i risiko for hjertesygdom, og du skal tage statiner, hvordan kan du så være sikker? siger Piper. Hvis [virksomheden] kan forudsige, hvordan kunden ser ud, er det en grundsandhed for tillid.

Gætteegenskaber

I genetik kaldes egenskaber som farven på dine øjne eller kolesteroltal for fænotyper. Disse fænotyper bestemmes, i større eller mindre grad, af dit særlige DNA eller din genotype.

Det er derfor, at det ikke kun er teoretisk muligt at identificere en persons ansigt ud fra deres DNA, men sandsynligvis vil være muligt om et par år, siger Mark Shriver, der arbejder med gener-til-ansigt forudsigelse ved afdelingen for antropologi i Penn State. Jeg tror, ​​det er i vores fremtid helt sikkert, siger han.

Forskere har dog stadig arbejde at gøre for at vide præcis, hvordan f.eks. dit DNA påvirker længden af ​​din næse eller bredden af ​​din mund eller klangen på din stemme. Shriver mener, at Venters papir ikke tilføjede meget til, hvad der allerede kan forudsiges ved hjælp af eksisterende DNA-tests, der måler din etniske makeup og sex.

At kalde det forudsige ud fra genomet er det, der er galt, siger Shriver. Hovedbudskabet er langt overdrevet. De havde bare ikke nok folk til at finde de gener, der adskiller mennesker. Dette er ikke papiret, der skal overbevise folk om, at dette vil påvirke privatlivets fred eller hjælpe efterforskning.

Privatlivsspørgsmål

Siden det blev startet i 2013, har Human Longevity mistet eller fyret flere medarbejdere. Halvdelen af ​​forfatterne til det nye papir arbejder for eksempel ikke længere i virksomheden. Och, Google-stjernen, forlod efter kort tid for blodprøvestartup GrailBio. Også væk er dens tidligere chefvidenskabsmand og informationschef.

En talsmand for Human Longevity sagde, at en sådan omsætning var normal. Som svar på spørgsmål om sit papir udgav virksomheden tirsdag en erklæring, hvor de bemærkede, at dets datasæt, baseret på 1.061 personer, ikke var ekstremt stort, og at der ville være behov for større kohorter for at lave meget mere præcise forudsigelser og identifikationer.

I sin erklæring bekræftede virksomheden imidlertid sin anfægtede påstand: Hvis du har et genom fra det offentlige domæne, kan forskere generere et billede af den pågældende person og dermed identificere denne person.

Venters blad havde ikke let ved at finde et forlag. Shriver siger, at han fungerede som anmelder af avisen for Videnskab , det førende amerikanske videnskabelige tidsskrift, hvor det to gange blev anmeldt og i sidste ende afvist. Den blev i stedet offentliggjort mandag i Proceedings of the National Academy of Sciences .

I pressedækningen af ​​hans resultat, greb Venter også nogle videnskabsmænd ved at bruge ansigtsforudsigelser til at argumentere for, at genomdata – især offentlige data – rummer en alvorlig ny privatlivsrisiko. Nemlig, hvis nogen havde adgang til dit afidentificerede genom, kunne de måske knytte det til dig ved at generere et fotografi.

Jeg har altid sagt til folk, at dit genom er mere end alle de andre numre i dit liv, der identificerer dig: dit kreditkortnummer, din fødselsdato, din adresse, dit cpr-nummer, fortalte Venter. San Diego Union-Tribune .

Dette privatlivsargument kunne dog ses som selvtjenstgørende, eftersom Venters pointe er, at private databaser, som hans, er mere tilbøjelige til at tilbyde den nødvendige beskyttelse.

Piper, den tidligere Human Longevity-medarbejder, siger, at han besluttede at tale om avisen, fordi han er uenig i Venters privatlivsargument. Genomics privatliv er vigtigt. Men det er ikke sådan man griber det an. Det er ikke, at vi ikke kan dele. Det er sådan at dele uden frygt, siger Piper. Det overordnede budskab i papiret er ikke noget, jeg er enig i.

skjule