Genom-undersøgelse forudsiger DNA fra hele Island

Administrerende direktør for et islandsk genjagtfirma siger, at han er i stand til at identificere alle fra det land, der har en dødelig kræftrisiko, men har ikke været i stand til at advare folk om faren på grund af etiske regler for DNA-forskning.

Kort viser, hvor almindelige visse risikofremkaldende DNA-mutationer er omkring Island.

Virksomheden, DeCode Genetik , baseret i Reykjavík, siger, at den har indsamlet fulde DNA-sekvenser på 10.000 individer. Og fordi folk på øen er nært beslægtede, siger DeCode, at det nu også kan ekstrapolere for nøjagtigt at gætte DNA-sammensætningen af ​​næsten alle andre 320.000 borgere i det land, inklusive dem, der aldrig har deltaget i dets undersøgelser.

Det rejser komplekse medicinske og etiske spørgsmål om, hvorvidt DeCode, som ejes af det amerikanske bioteknologiske selskab Amgen, vil være i stand til at informere offentligheden, hvis de er i fare for dødelige sygdomme.

Kári Stefánsson, lægen, der er grundlægger og administrerende direktør for DeCode, siger, at han er bekymret for mutationer i et gen kaldet BRCA2, der giver en markant øget risiko for bryst- og æggestokkræft. DeCodes data kan nu identificere omkring 2.000 mennesker med genmutationen på tværs af Islands befolkning, og Stefánsson sagde, at virksomheden har været i forhandlinger med sundhedsmyndighederne om, hvorvidt de skulle advare dem.

Vi kunne redde de her mennesker fra at dø for tidligt, men det er vi ikke, for det er vi som samfund ikke blevet enige om, siger Stefánsson. Jeg synes personligt, at det ikke er en forbrydelse at redde folk med disse mutationer. Dette er en enorm risiko for et stort antal mennesker.

Det islandske velfærdsministerium sagde, at en særlig komité var blevet nedsat til at regulere sådanne tilfældige fund og ville foreslå regler inden udgangen af ​​året.

Kári Stefánsson

Teknikken, som DeCode bruger til at forudsige folks gener, giver fingerpeg om fremtiden for såkaldt præcisionsmedicin i andre lande, herunder USA, hvor præsident Barack Obama i år opfordrede forskere til at samle en gigantisk database med en million mennesker (se USA til Udvikle DNA-undersøgelse af en million mennesker). En stor nok amerikansk database kunne også bruges til at udlede gener fra mennesker, om de havde tilsluttet sig den eller ej, siger Stefánsson, og kunne rejse lignende spørgsmål om, hvorvidt og hvordan man rapporterer sundhedsfarer til offentligheden.

Denne teknik kan anvendes på enhver befolkning, siger Myles Axton, chefredaktør for Naturgenetik , tidsskriftet, hvori DeCode i dag præsenterede nogle af sine resultater. Han sagde, at den lille øs detaljerede genealogiske optegnelser er grunden til, at den først blev opnået i Island.

Forskellige juridiske og etiske forhindringer forhindrer i øjeblikket DeCode i at advare personer, der er i fare. Frivillige, der tilmeldte sig DeCodes undersøgelser, blev lovet anonymitet, og også at de ikke ville lære om forskningsresultater. Bioetikere anerkender, at folk har ret til ikke at kende til genetiske farer, hvilket betyder, at de ikke bare kan få at vide.

Reglen er, at man kun må bruge og blotlægge genetiske data, hvis man har tilladelse fra den pågældende, siger Gísli Pálsson , en antropolog ved Islands Universitet. Men dette er hinsides informeret samtykke. Folk er ikke engang med i undersøgelserne, de har ikke indsendt noget samtykke eller endda en prøve, alligevel hævder virksomheden at have viden om disse mennesker, og at der er en sundhedsrisiko.

Pálsson siger, at traditionelle forestillinger om medicinsk etik nu er i åben konflikt med målene og mulighederne for præcisionsmedicin. Han mener, at sådanne standarder skal justeres på grundlæggende måder i fremtiden, så der lægges større vægt på fordele for folkesundheden frem for individuelle privatlivsrettigheder.

Den forventede levetid for kvinder med BRAC2-mutationen er 12 år mindre end for kvinder uden den, fordi 86 procent af dem, der har den, vil udvikle kræft. Mænd er også ramt, fordi mutationen øger chancen for prostatakræft. Stefansson siger, at mange af disse dødsfald kunne undgås ved forebyggende kirurgi, såsom en mastektomi.

Vi kunne i Island ved et tryk på en knap finde alle kvinder med en mutation i BRCA2-genet, siger Stefánsson. Det er et lille lille eksempel på, hvad du kan. Du kan bruge dette i forebyggende medicin som aldrig før.

DeCodes data kan muligvis også forudsige, hvem i befolkningen, der har forhøjet relativ risiko for Alzheimers sygdom, eller hvem der har et udiagnosticeret indlæringsvanskeligheder.

DeCode blev startet i 1996 med ideen om at koble DNA-forskning til Islands nationale sundhedssystem (se Population Inc.). Landets situation er unik på grund af dets omhyggeligt opbevarede genealogiske optegnelser, som går tilbage til det niende århundrede, hvor øen blev bosat. Det betyder også, at de fleste islændinge i det mindste er fjerne fætre.

DeCode har genereret grove genkort, kaldet genotyper, på omkring 150.000 islændinge. For nylig har fremskridt inden for DNA-sekventeringsteknologi gjort det muligt at opnå komplette genomsekvenser på omkring 10.000 mennesker, siger Stefánsson, eller omkring en ud af 30 islændinge. Resultater fra de første 2.636 fulde genomer blev rapporteret af virksomheden i dag i Naturgenetik .

Kombineret med genealogiske tabeller er disse data det, der tillader DeCode at imputere genomerne fra næsten alle født af islandske forældre. Det er fordi, når det fulde genom af nogle mennesker i et stamtræ er kendt, kan de andres gener udledes.

Sean Harper, leder af R&D hos Amgen, kalder DeCodes evne til at gætte folks DNA for en gåde. Han siger, at det dog ikke er et ukendt problem for genetikere, da rutinemæssige DNA-tests af én person ofte afslører oplysninger om nære slægtninge. Men det er aldrig før sket på niveau med en hel nation.

Det er en gråzone fra et bioetisk perspektiv, men vi ville være tilbøjelige til at give dataene eller i det mindste en meddelelse, siger Harper. Han siger, at Amgen, som bruger genoplysninger fra DeCode til at vejlede sin lægemiddelforskning, ikke havde planer om at opkræve nogen for de risikooplysninger, den har udviklet. Det ville ikke være passende [at] forsøge at gøre det til en kommerciel proces, siger han.

USA mangler en lignende national database, selvom nogle private virksomheder, som 23andMe og Ancestry.com, har genereret grove genkort over flere millioner mennesker i alt. National Institutes of Health planlægger at bruge millioner i de kommende år på at akkumulere fulde genomdata om titusindvis af mennesker.

Det betyder, at hele verden snart vil konfrontere de samme typer etiske dilemmaer, som Island står over for nu, siger Pálsson. Har du ret til at rode med folks liv i massivt omfang? Du kan sige til din nabo: ’Du ryger for meget.’ Men det er en anden ting at henvende sig til 1.000 mennesker og sige: ’Du har BRCA2-mutationen,’ siger han.

skjule