211service.com
Kræftens 'World Wide Web'
I flere år har klinikere og dataloger i USA og i udlandet forsøgt at forbedre kræftbehandlingen – fra diagnose til behandling – ved at bygge store, indbyrdes forbundne databaser fulde af patientinformation. De kalder disse depoter for medicinske gitter og forestiller sig den dag, hvor en læge i Strasbourg eller New Delhi for eksempel kan se, at et uudsigeligt billede af en patients lunge er meget lig billedet af en San Francisco-patient, hvis sagshistorie kunne danne grundlag for beslutningen. at udføre en biopsi.
Disse begyndende databaser omfatter ikke kun patienters sygehistorier, herunder sådanne data som MR'er og CT-scanninger, men også oplysninger om, hvordan de har reageret på lægemidler. Men fordelene ved disse underbygningsnet har været langsomme til at komme, dels på grund af tekniske problemer, og dels fordi føderale regler om privatliv gør datadeling vanskelig. Nu kunne et National Cancer Institute-projekt teste et multihospitalt system til sammenligning af lungekræftbilleder allerede i år - et klart skridt hen imod at tage gitter i brug.
Denne historie var en del af vores marts 2006-udgave
- Se resten af problemet
- Abonner
Kenneth H. Buetow, direktør for instituttets Center for Bioinformatik i Bethesda, MD, kalder det et afgørende første skridt mod et World Wide Web af kræftforskning.
I det seneste år eller deromkring har Buetow og hans team indsamlet mere end 50.000 billeder af lungekræft opnået fra medicinske forsøg og arkiveret dem i et sikkert elektronisk depot hos NCI. Deres indsats er en del af et treårigt pilotprojekt på 60 millioner dollars, der blev lanceret i 2004, og som involverer 50 kræftcentre og mere end 600 forskere. Arkivet er nu tilgængeligt på internettet kl http://ncia.nci.nih.gov . Ud over andre billeddiagnostiske projekter indeholder den en stor samling af lungekræfttilfælde, der er fulgt under deres behandling.
Med databasen nu stort set på plads, er testning nært forestående. Billedsamlingen skal tilskynde til og lette forskning i ny software, der automatisk kan sammenligne billeder af lunger med dem, der allerede findes i databasen. I sådan software vil algoritmer søge efter fællestræk og opbygge en mappe med de mest sandsynlige matches. Klinikere på kontorer og hospitaler vil være i stand til at sammenligne de resulterende lungebilleder med de scanninger, de skal bruge for at evaluere.
Sammenligning af billeder er kun det første skridt. Hvis alt går vel, håber National Cancer Institute inden for tre år at gennemføre et eller flere kliniske forsøg, hvor en stor mængde medicinske data om lungekræft – inklusive billeder, typer af tumorer, lægemiddelforløb, patientforløb, selv de molekylære profiler af lungekræft. sygdom – ville blive brugt af læger, der studerer specifikke tilfælde. Resultaterne af disse sager vil blive sammenlignet med resultaterne af sager behandlet gennem konventionelle tilgange til kræftdiagnose. Denne sammenligning skulle give information ikke kun om patienternes medicinske respons, men også om den nøjagtighed, hvormed lægerne stillede deres diagnoser, og endda i hvilken grad de overholdt standarderne for medicinsk privatliv.
Medicinske gitterforskere mangler ikke syn. Sammenligning af billeder er kun det første skridt. I tilfælde, hvor scanningerne matcher, håber lægerne at kunne bore dybere ind i historien om lignende tilfælde og lære, hvilke lægemidler eller operationer der virkede bedst. Og Buetow siger, at hans forsøg faktisk kunne fremskynde dagen, hvor nogle kræftdiagnoser er automatiserede. En læge kunne indtaste billeder (og efterhånden som gitteret udvides, blodprøveresultater, beskrivelser af genetiske markører og andre patientdata) og lære, hvor ofte næsten identiske testresultater fra patienter rundt om i verden korrelerer med specifikke maligniteter såsom lymfomer, melanomer, eller sarkomer.
Og i fremtiden, efterhånden som omkostningerne til gensekventering falder, kan NCI's gitter endda omfatte patienters genomiske informationer. Styrken ved nettet ligger i dets evne til at aggregere og korrelere flere og flere folkesundhedsdata fra hele verden, sagde Mary Kratz fra University of Michigan Medical School, en teknisk rådgiver for netforskningssamfundet. Jo mere data du har, jo mere viden genererer du.
I mellemtiden skal verdslige tekniske problemer løses.
Da de data, der ledsager billeder, varierer i type og format fra hospital til hospital, udvikler forskere standardformater, der kan harmonisere dem alle. Vi beder forskere ved mange konkurrerende institutioner om at rive barriererne ned for at dele enorme mængder data, siger Howard Bilofsky, senior fellow ved Center for Bioinformatics ved University of Pennsylvania, som deltager i NCIs projekt. At være i stand til at dele information i net over hele verden inden for biovidenskabsforskning er ikke noget, der er let at gøre.