Nye test skærme potentielle forældre for 100-plus sygdomme

Counsyl , en Stanford-startup baseret i Redwood City, Californien, har udviklet en genetisk test til kommende forældre, der bestemmer deres risiko for at overføre mere end 100 forskellige genetiske sygdomme til deres barn. Testen, som koster 349 $ og allerede er dækket af nogle store forsikringsselskaber, kan hurtigt udvide screeningen for forudindtagethed for sjældne arvelige tilstande. For de fleste mennesker er screeningsanbefalinger i øjeblikket begrænset til den kroniske lungesygdom cystisk fibrose, med bredere test, der tilbydes til nogle etniske grupper.

Graviditetsscreening: For at bestemme risikoen for at overføre sjældne arvelige sygdomme til deres afkom, spyttede kommende forældre i et rør (vist her) og sender derefter prøven til Counsyl, en Californien-baseret startup. Virksomheden screener prøven for genetiske mutationer forbundet med mere end 100 sygdomme.

Mens de genetiske syndere for mere end 1.000 sjældne arvelige sygdomme er blevet identificeret, har screening for dem været begrænset, hovedsageligt på grund af omkostningerne. Den omfattende karakter af Counsyls test og dens rimelige pris afspejler hurtige fremskridt inden for screeningsteknologier. Da testning af cystisk fibrose først startede i begyndelsen af ​​90'erne, kostede det i størrelsesordenen $350, siger Philip Reilly , en klinisk genetiker, nu hos Third Rock Ventures, et Boston-baseret investeringsfirma. Nu tilbyder [Counsyl] at teste for 100 lidelser til samme pris, og det vil falde lavere. I slutningen af ​​1990'erne lancerede Reilly, som ikke er involveret i Counsyl, et lignende firma, som han siger mislykkedes, delvist fordi test stadig var for dyrt.

Counsyls test opdager genetiske varianter forbundet med sjældne arvelige tilstande såsom cystisk fibrose, Tay-Sachs sygdom og Pompes sygdom, en stofskiftesygdom, der er omtalt i den nye film Ekstraordinære Foranstaltninger . (Counsyl, som indtil for nylig fungerede i stealth-tilstand, ser ud til at have knyttet sin offentlige debut til filmens udgivelse.) Mens personer, der bærer en enkelt kopi af mutationen for sådanne sygdomme, typisk er raske, er de, der arver to kopier, en fra hver forælder, vil med garanti udvikle det. Mange af disse sygdomme er uhelbredelige og har ødelæggende konsekvenser, herunder tidlig død.

Hyppigheden af ​​enkelt-gen lidelser i USA anslås til omkring 0,3 til 0,5 procent af levende fødsler. Ifølge Counsyl er omkring 35 til 40 procent af de mennesker, der har taget dens test, bærere af mindst én sygdom i testen. Begge potentielle forældre bærer mutationen omkring 0,6 til 0,8 procent af tiden. Disse par ville have en 25 procent chance for at få et barn med sygdommen, takket være en 50 procent chance for at arve sygdomsvarianten fra hver forælder.

De genetiske varianter, der screenes i Counsyls test, er ikke i sig selv nye - alle kan testes for individuelt eller som en del af andre screeninger. (Ashkenazi-jøder gennemgår f.eks. ofte screening for en håndfuld arvelige lidelser, der forekommer hyppigere i den gruppe.) Det nye i Counsyls test kommer i at gruppere et så stort antal tilstande – virksomhedens grundlæggere siger, at den kan opdage flere hundrede varianter, der er ansvarlige for mere end 100 forskellige genetiske sygdomme.

Hvis forældre opdager, at de begge bærer risikovarianter for den samme sygdom, kan de vælge at gennemgå in vitro-befrugtning og få screenet embryoner for sygdommen, inden de bliver implanteret i livmoderen. Eller kvinden kan vælge at blive gravid på normal vis, og så kan de få fosteret screenet under graviditeten.

Testning vil sandsynligvis føre til en stigning i teknikker såsom in vitro fertilisering og præimplantation genetisk diagnose, som tilsammen koster omkring $12.000 til $17.000. Men det tal er stadig drastisk lavere end de hundredtusindvis til millioner af dollars, det kan koste at tage sig af et barn med en alvorlig genetisk lidelse. Det er derfor, vi fik forsikringsdækning så hurtigt, hvilket er ekstremt usædvanligt for en ny diagnostisk test, siger Balaji S. Srinivasan, teknologichef hos Counsyl.

Ud over at få testen gennem fertilitetsklinikker, kan forbrugere bestille den direkte via internettet, svarende til tjenester leveret af startups 23andMe, Navigenics og DecodeMe. Selvom disse virksomheder i vid udstrækning har været banebrydende for konceptet med direkte-til-forbruger genetisk testning – og opnået omfattende medieopmærksomhed ved at gøre det – er deres mål meget anderledes end Counsyls. Deres skærme er designet til at detektere almindelige genetiske varianter, der har en forholdsvis lille indvirkning på en persons risiko for en række almindelige sygdomme, mens Counsyls test opdager sjældne genetiske varianter forbundet med alvorlige sygdomme hos mennesker, der bærer to kopier af det.

Reilly forudser, at andre virksomheder snart vil følge trop. Jeg tror, ​​der vil være masser af andre grupper, der tilbyder lignende tests i fremtiden, siger han. Der er ingen grund til, at 23andme ikke kunne gøre dette, eller Navigenics eller Baylor eller Mayo-klinikken.

Counsyl bruger en teknologi kaldet et molekylært inversionsprobearray, som kan fange små udvalgte stykker DNA og tillade dem at blive analyseret med høj nøjagtighed. Srinivasan siger, at virksomheden vil offentliggøre detaljer om metoden såvel som dens nøjagtighed i et peer-reviewed tidsskrift i denne uge. Han siger, at virksomheden også planlægger at ændre sine screeningsmetoder i den nærmeste fremtid ved at bruge gensekventeringsteknologi, som bestemmer hvert bogstav i de udvalgte gener.

Testen er ikke idiotsikker. Det opdager ikke en række genetiske og miljømæssige faktorer, der kan påvirke en sund graviditet. Derudover er mange af de mutationer, der ligger til grund for betingelserne omfattet af testen, endnu ikke blevet opdaget, hvilket betyder, at nogen stadig kan være en bærer.

skjule