211service.com
Raketbrændstoffet til Bidens Cancer Moonshot? Big Data
Hvis vicepræsident Joe Biden Cancer Moonshot kommer virkelig til dobbelt tempo af fremskridt med at forebygge, diagnosticere og behandle kræft, vil det have brug for meget mere data. Det betyder, at det sandsynligvis vil have brug for flere datadelingsordninger, som en annonceret på dagens Cancer Moonshot Summit i Washington, D.C., mellem National Cancer Institute og Foundation Medicine, et biotekfirma, der sælger tests, der sekvenserer tumorgenomer.
For at fremskynde fremskridt har Biden hedder for mere datadeling og samarbejde mellem kræftforskere i den akademiske verden, industrien og regeringen. Foundation, som vil give NCI genomiske profiler af tumorer fra 18.000 voksne, er den første virksomhed, der bidrager til NCI's nye Genomic Data Commons , en offentlig database og analyseplatform for cancergenomik. De nye data fordobler størrelsen af databasen, hvilket er afgørende for Bidens projekt og for præsident Obamas Precision Medicine Initiative . Det vil hjælpe forskere med at studere genetiske abnormiteter set i mange kræftformer, og det kan også være med til at føre til nye muligheder for behandling.
Vicepræsident Joe Biden leder en indsats for at fremskynde kræftforskningen.
Før i dag indeholdt NCIs database sekventeringsoplysninger fra tumorer fra omkring 14.500 patienter med kræft, inklusive kliniske data om, hvordan de reagerede på lægemidler. Store databaser som denne kunne hjælpe forskerne med bedre at forstå karakteren af kræftformer og finde ledetråde til, hvorfor nogle tumorer reagerer på lægemidler, og andre ikke gør, og hvorfor nogle reagerer og derefter vender tilbage.
Informationen fra Foundation er ikke så omfattende; den vil ikke indeholde oplysninger om, hvordan patienter reagerede på lægemidler. Ikke desto mindre er det en dramatisk tilføjelse til NCI's eksisterende dataressourcer, siger Louis Staudt, direktør for NCI's Center for Cancer Genomics . Jo større datasættet er, jo større er chancen for, at nye ting bliver opdaget. Ved mere end at fordoble antallet af patienter vil vi enormt øge databasens forklaringskraft til at forstå kræft, siger Staudt.
Idéen med præcisionsmedicin er at bruge så meget biologisk information som muligt for at sikre, at behandlingerne er mere præcist skræddersyet til individer og deres sygdomme. Udfordringen ved at gøre dette for kræft er, at det langt fra er en enkelt sygdom - der er kl mindst 200 formularer og mange flere undertyper, defineret af specifikke abnormiteter i tumorgenomer.
Nogle patienter har tumorer med abnormiteter, der kun ses hos en ekstremt lille del af mennesker med den slags kræft, siger Staudt, og i nogle tilfælde er der medicin, der virker mod de sjældne kræftformer. Der kan være lignende ualmindelige ændringer, som endnu ikke er blevet fundet og kan repræsentere nye mål for lægemidler. Tilføjelse af flere patienter til NCI's database øger dens evne til at hjælpe med at opdage dem.
Staudt håber, at donationen fra Foundation Medicine vil inspirere til lignende tiltag fra andre grupper med datasæt, der ville være værdifulde for cancergenomik. NCI vil også generere sine egne nye data gennem innovative kliniske forsøg som f.eks NCI-MATCH , som er fokuseret på at teste målrettede terapier på et stort antal patienter, hvis tumorer indeholder specifikke abnormiteter.
Ideelt set er der brug for en samling, der omfatter både store mængder patientsekvensinformation og detaljeret klinisk information, især om behandlingsresultater, siger Clifford Hudis, administrerende direktør for American Society of Clinical Oncology. Det betyder, at læger bliver nødt til at forbedre deres dataindtastning i lægejournaler, og dataene skal kunne læses af computere, siger han.
Men at bringe denne type information sammen vil også blive kompliceret af bekymringer om patientens privatliv og love, der regulerer deling af sådanne data. Og kommercielle enheder vil ikke altid være villige til at skille sig af med deres data. Foundation siger, at det har gjort det i dette tilfælde for at fremskynde præcisionsmedicin. Måske giver det her os et løft, siger Hudis.