211service.com
Søgning efter sygdomsspor i genetisk mangfoldighed
I løbet af de sidste par år har forskere opdaget hundredvis af genetiske varianter forbundet med sygdom. Men langt størstedelen af den forskning har fokuseret på mennesker af europæisk, asiatisk og afrikansk afstamning. En ny indsats for at katalogisere genetisk mangfoldighed blandt mennesker i Mexico – som sammen med andre latinamerikanere har en unik herkomst – kunne kaste lys over sygdomme, der påvirker disse grupper uforholdsmæssigt, og på hvorfor nogle lægemidler kan virke mere eller mindre effektivt i disse populationer. Forskningen kan også hjælpe med at afdække sjældne genetiske varianter, der er ansvarlige for en betydelig del af den genetiske risiko for sygdom.
Smeltning kan: En ny indsats for at studere genetisk diversitet i latinamerikanere, specifikt i Mexico, kan kaste lys over sygdomme, såsom type 2-diabetes, der rammer denne gruppe uforholdsmæssigt.
Hvis personlig medicin skal blive et globalt fænomen, så er videnskabsmænd nødt til at forstå genomerne af alle verdens befolkninger, siger Gerardo Jimenez-Sanchez , tidligere direktør for National Institute of Genomic Medicine, i Mexico. (Instituttet, oprettet i 2004 og kendt under akronymet INMEGEN , er analog med U.S. National Human Genome Research Institute.)
Hispanics er et relativt ungt - omkring 500 år gammelt - amalgam af tre store kontinentale grupper - europæiske, indianske og afrikanske - og udgør omkring 15 procent af verdens befolkning. Inden for dette område er der så meget miljømæssig og genetisk variation, at du virkelig kan udnytte den iboende mangfoldighed til din videnskabelige fordel, siger Esteban Burchard , en læge og videnskabsmand ved University of California, San Francisco. For eksempel, hvis en bestemt sygdom er meget mere almindelig i en forfædres gruppe, behøver videnskabsmænd kun at screene det DNA, der er arvet fra den gruppe hos en person af blandet herkomst. Det reducerer markant mængden af DNA, der skal undersøges for at finde gener forbundet med sygdommen.
Forskere håber at fange noget af denne mangfoldighed med det nyligt annoncerede Slim Initiative for Genomic Health, et partnerskab på $65 millioner mellem Broad Institute, et genomforskningsinstitut i Cambridge, MA, og Carlos Slim Health Institute, en nonprofit baseret i Mexico City. Forskningen vil fokusere på det genetiske grundlag for type 2-diabetes i mexicanske og latinamerikanske befolkninger, samt på genomikken af kræft på verdensplan.
Det meste arbejde med diabetes blev udført i europæiske befolkninger, og meget vil blive lært af at se på andre befolkningsgrupper, siger Eric Lander , direktør for Bredden. Selvom de grundlæggende mekanismer er de samme i alle populationer, vil særlige genetiske varianter være forskellige, så det vil være lettere at finde nogle gener i nogle populationer. Type 2-diabetes forekommer med en særlig høj frekvens i latinamerikanske befolkninger, og der er grund til at tro, at det indianske bidrag til genpuljen har en vis effekt, tilføjer han. Mens de specifikke detaljer om initiativet stadig er under planlægning, vil det omfatte både gensekventering og mikroarray-baserede undersøgelser. Meget af det indledende arbejde vil blive udført på Bredden.
Den nye forskning vil bygge på de seneste bestræbelser på at katalogisere Mexicos genetiske mangfoldighed. Sidste år udgav Jimenez og samarbejdspartnere en mexicansk version af HapMap, et kort over almindelige genetiske variationer i Proceedings of the National Academy of Sciences . Det originale HapMap, færdiggjort i 2005 og delvist udviklet på Broad, gjorde det muligt for videnskabsmænd at designe DNA-mikroarrays oversået med disse almindelige variationer. Disse chips er blevet brugt til at screene titusindvis af menneskers genomer for at søge efter genetiske variationer, der forekommer hyppigere hos mennesker med specifikke sygdomme.
Det originale HapMap udelukkede dog næsten helt indfødte amerikanere, hovedsagelig på grund af politisk modstand fra oprindelige grupper. Og de fleste latinamerikanere er en del af indianere - en nylig undersøgelse i Mexico City viste, at 70 procent af deltagernes herkomst var indianer, siger Burchard. Det betyder, at HapMap ikke gælder for nutidige Latino-befolkninger, siger han.
Det første udkast til det mexicanske HapMap har allerede afsløret en unik fordeling af genetiske variationer, kaldet SNP'er (single nucleotid polymorphisms). Vi kan tydeligt se forskellige komponenter i blandingsmønsteret i den mexicanske befolkning, siger Jimenez. Vi kan også observere, at den mexicanske befolkning er en række blandinger fra de individer, der er meget europæiske til dem, der er meget oprindelige. Forskere vil bruge disse oplysninger til at designe fremtidige undersøgelser, der mere effektivt kan identificere sygdomsbundne gener.
Forskere bruger nu kortet til at analysere mexicansk afstamning - landet er hjemsted for 65 indfødte grupper - og til at køre genom-dækkende associationsundersøgelser af hjerte-kar-sygdomme, fedme, type 2-diabetes og aldersrelateret makuladegeneration. Foreløbig forskning afslørede en genetisk variation forbundet med høje niveauer af kolesterol og triglycerider, som kun ser ud til at være almindelig hos latinamerikanske mennesker.
Jimenez, der er formand for Bioteknologikommissionen for Organisationen for Økonomisk Samarbejde og Udvikling, siger, at resultaterne vil vise sig at være vigtige for det spirende felt af personlig medicin og for farmaceutiske virksomheder, der udvikler genetisk målrettede lægemidler. Man kan ikke ekstrapolere risikoen for sygdom fra europæere, siger han. Du skal sørge for at udvikle produkter og tjenester baseret på den genetiske sammensætning af mexicanske befolkninger. Genomisk medicin er ikke noget, vi kan udvikle i USA og eksportere til verden.