211service.com
Stop brystkræft med hjælp fra AI
Den amerikanske regering ønsker at finde ud af, om kunstig intelligens kan hjælpe læger med at diagnosticere og behandle brystkræft mere effektivt.
I et forsøg på at finde målrettede behandlinger for særligt invasive typer af brystkræft, der ikke reagerer godt på eksisterende lægemidler, annoncerede Forsvarsministeriet i denne uge, at det hyrer biofarma-virksomheden Berg Health til at bruge AI til at opdage lægemidler. Partnerskabet støtter Det Hvide Hus's Cancer Moonshot-initiativ for at screene op til 250.000 patientprøver i jagten på nye biologiske indikatorer eller biomarkører for de tidligste tegn på kræft. Mens dødsraten fra brystkræft er faldet støt i løbet af de sidste to årtier, er det fortsat den næststørste dræber blandt kræftformer hos kvinder i USA, ifølge National Cancer Institute.
Under partnerskabet får Berg adgang til DoD's Clinical Breast Care Project, en bank med 13.600 prøver af både sundt og sygt væv fra næsten 8.000 patienter.
En Berg-forsker bruger en centrifuge til at behandle prøver i virksomhedens laboratorium. Berg har udviklet en kunstig intelligens-platform til hurtigt at screene patientvævsprøver for potentielle lægemiddelmål.
Berg vil starte med at sekventere prøver fra raske donorer og dem med forskellige undertyper af brystkræft, som vil generere genomisk og anden information om mutationer, proteiner og cellulære processer, der findes i kræftceller og raske celler. Disse data vil derefter blive kombineret med patienters kendte sygehistorier og ført ind i Bergs AI-baserede platform, som vil producere forskellige modeller af sundt og sygt væv ved hjælp af billioner af datapunkter. Platformens algoritmer vil så hjælpe med at finde mønstre – hot spots eller hubs – i molekylære signaturer på tværs af disse modeller. Sådanne mønstre kunne repræsentere biomarkører eller lægemiddelmål.
Berg starter med data og tillader dataene at generere hypoteser - det omvendte af den proces, der er almindelig i lægemiddelopdagelse, siger Niven Narain, Bergs medstifter, præsident og CEO.
Startups, herunder AtomWise, Insilico Medicine og TwoXAR, tager lignende tilgange ved at bruge specialbyggede AI-platforme for at hjælpe med at eliminere noget af gætværket, der er involveret i traditionel lægemiddelopdagelse.
Narain mener, at der er andre undertyper af brystkræft, som forskerne endnu ikke har identificeret, og han håber, at Berg kan hjælpe med at identificere dem såvel som lægemiddelmål for kendte undertyper. Nøglebiomarkører opdaget under dette samarbejde kan føre til en blodprøve for brystkræft, en meget mindre invasiv procedure end de biopsier, der kræves i dag.
Målrettede kræftbehandlinger som brystkræftbehandlingen trastuzumab, kendt som Herceptin, har vist utroligt lovende, men de virker ikke på alle patienter, fordi de er designet til specifikke genetiske mutationer i tumorer. Omkring 25 procent af brystkræftpatienter har en undertype kendt som HER2 -positiv sygdom, som i nogle tilfælde kan behandles effektivt med Herceptin i de tidlige stadier. Men ikke alle patienter på Herceptin reagerer på lægemidlet, en indikation af, at andre biologiske faktorer er i spil, siger Narain.
Berg har allerede brugt sin AI-platform til at identificere og fremme et eksperimentelt lægemiddel, der har potentialet til at bremse eller vende kræftcellevækst ved at ændre en driver, der menes at være involveret i forskellige typer kræft. Det afprøvede lægemiddel er i øjeblikket i et fase II klinisk forsøg for fremskreden bugspytkirtelkræft, i kombination med et almindeligt kræftlægemiddel.